Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD1P98174 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD1P98174 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD1P98174 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD1P98174 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD1P98174 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD1P98174 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD1P98174 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD1P98174 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD1P98174 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD1P98174 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD1P98174 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD1P98174 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD1P98174 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD1P98174 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD1P98174 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD1P98174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD1P98174 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD1P98174 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGD1P98174 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGD1P98174 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD1P98174 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD1P98174 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD1P98174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD1P98174 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD1P98174 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD1P98174 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FGD1P98174 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGD1P98174 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGD1P98174 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGD1P98174 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD1P98174 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD1P98174 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD1P98174 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD1P98174 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD1P98174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD1P98174 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD1P98174 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD1P98174 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD1P98174 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD1P98174 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms