Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apba2P98084 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apba2P98084 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Apba2P98084 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Apba2P98084 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Apba2P98084 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Apba2P98084 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apba2P98084 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Apba2P98084 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apba2P98084 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apba2P98084 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Apba2P98084 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Apba2P98084 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apba2P98084 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apba2P98084 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms