Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ElocP83940 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ElocP83940 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ElocP83940 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ElocP83940 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ElocP83940 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ElocP83940 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ElocP83940 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ElocP83940 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ElocP83940 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ElocP83940 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ElocP83940 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ElocP83940 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ElocP83940 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ElocP83940 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ElocP83940 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ElocP83940 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ElocP83940 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ElocP83940 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ElocP83940 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ElocP83940 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ElocP83940 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ElocP83940 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ElocP83940 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ElocP83940 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ElocP83940 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ElocP83940 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ElocP83940 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ElocP83940 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ElocP83940 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ElocP83940 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ElocP83940 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ElocP83940 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElocP83940 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElocP83940 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElocP83940 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElocP83940 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ElocP83940 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ElocP83940 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ElocP83940 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ElocP83940 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ElocP83940 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ElocP83940 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ElocP83940 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ElocP83940 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ElocP83940 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ElocP83940 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ElocP83940 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ElocP83940 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms