Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx2P81066 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx2P81066 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx2P81066 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx2P81066 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx2P81066 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx2P81066 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx2P81066 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx2P81066 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Irx2P81066 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms