Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx1P80205 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Otx1P80205 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Otx1P80205 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms