Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CiitaP79621 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CiitaP79621 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CiitaP79621 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CiitaP79621 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CiitaP79621 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CiitaP79621 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms