Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat1P70339 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat1P70339 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat1P70339 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat1P70339 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frat1P70339 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frat1P70339 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frat1P70339 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frat1P70339 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Frat1P70339 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frat1P70339 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms