Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntn5P68500 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn5P68500 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn5P68500 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms