Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM4P67936 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM4P67936 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM4P67936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM4P67936 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM4P67936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM4P67936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM4P67936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM4P67936 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM4P67936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM4P67936 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM4P67936 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM4P67936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM4P67936 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM4P67936 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM4P67936 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM4P67936 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM4P67936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM4P67936 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM4P67936 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM4P67936 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TPM4P67936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM4P67936 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM4P67936 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM4P67936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM4P67936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM4P67936 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM4P67936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM4P67936 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM4P67936 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM4P67936 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM4P67936 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM4P67936 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM4P67936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM4P67936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TPM4P67936 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM4P67936 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM4P67936 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPM4P67936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM4P67936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM4P67936 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM4P67936 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM4P67936 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM4P67936 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM4P67936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM4P67936 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM4P67936 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM4P67936 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM4P67936 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms