Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2bP67871 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2bP67871 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2bP67871 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk2bP67871 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms