Protein–RNA interactions for Protein: P63318

Prkcg, Protein kinase C gamma type, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcgP63318 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcgP63318 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcgP63318 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkcgP63318 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms