Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPNP63162 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPNP63162 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPNP63162 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPNP63162 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms