Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmgb1P63158 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgb1P63158 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb1P63158 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms