Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P63121 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63121 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms