Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl30P62889 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl30P62889 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl30P62889 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl30P62889 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl30P62889 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms