Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS25P62851 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS25P62851 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS25P62851 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS25P62851 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS25P62851 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS25P62851 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS25P62851 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS25P62851 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS25P62851 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS25P62851 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS25P62851 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS25P62851 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS25P62851 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS25P62851 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS25P62851 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS25P62851 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS25P62851 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS25P62851 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS25P62851 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS25P62851 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS25P62851 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS25P62851 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS25P62851 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS25P62851 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS25P62851 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms