Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPEP62304 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPEP62304 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPEP62304 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms