Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufm1P61961 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufm1P61961 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufm1P61961 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufm1P61961 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ufm1P61961 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufm1P61961 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufm1P61961 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ufm1P61961 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufm1P61961 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufm1P61961 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufm1P61961 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufm1P61961 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufm1P61961 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.5 ms