Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPZ1P61923 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ1P61923 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms