Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vbp1P61759 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vbp1P61759 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vbp1P61759 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms