Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NP61088 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NP61088 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms