Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP6P59044 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP6P59044 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP6P59044 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms