Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00310P59036 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00310P59036 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00310P59036 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00310P59036 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms