Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms