Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMDP57764 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMDP57764 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GSDMDP57764 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms