Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCBP4P57723 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCBP4P57723 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCBP4P57723 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms