Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCBP3P57721 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCBP3P57721 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms