Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2BFSP57053 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2BFSP57053 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms