Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1P56716 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rp1P56716 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1P56716 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1P56716 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp1P56716 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1P56716 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rp1P56716 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp1P56716 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1P56716 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1P56716 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms