Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp1P56183 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp1P56183 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp1P56183 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms