Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSE1LP55060 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSE1LP55060 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms