Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acod1P54987 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acod1P54987 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acod1P54987 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acod1P54987 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acod1P54987 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acod1P54987 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms