Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad23bP54728 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad23bP54728 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad23bP54728 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad23bP54728 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms