Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATN1P54259 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATN1P54259 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATN1P54259 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATN1P54259 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATN1P54259 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATN1P54259 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATN1P54259 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATN1P54259 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATN1P54259 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATN1P54259 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATN1P54259 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATN1P54259 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATN1P54259 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATN1P54259 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATN1P54259 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATN1P54259 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATN1P54259 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATN1P54259 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATN1P54259 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATN1P54259 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATN1P54259 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATN1P54259 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATN1P54259 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATN1P54259 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATN1P54259 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATN1P54259 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATN1P54259 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATN1P54259 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATN1P54259 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATN1P54259 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATN1P54259 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATN1P54259 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATN1P54259 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATN1P54259 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATN1P54259 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATN1P54259 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATN1P54259 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATN1P54259 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATN1P54259 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATN1P54259 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATN1P54259 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATN1P54259 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATN1P54259 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATN1P54259 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATN1P54259 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATN1P54259 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATN1P54259 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATN1P54259 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATN1P54259 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATN1P54259 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATN1P54259 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATN1P54259 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATN1P54259 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATN1P54259 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATN1P54259 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATN1P54259 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATN1P54259 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATN1P54259 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATN1P54259 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATN1P54259 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATN1P54259 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATN1P54259 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATN1P54259 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATN1P54259 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATN1P54259 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATN1P54259 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATN1P54259 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATN1P54259 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms