Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLG1P53597 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLG1P53597 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms