Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACLYP53396 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACLYP53396 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ACLYP53396 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ACLYP53396 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACLYP53396 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACLYP53396 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACLYP53396 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACLYP53396 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACLYP53396 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACLYP53396 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ACLYP53396 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACLYP53396 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACLYP53396 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ACLYP53396 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACLYP53396 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ACLYP53396 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ACLYP53396 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACLYP53396 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACLYP53396 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACLYP53396 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ACLYP53396 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACLYP53396 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACLYP53396 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACLYP53396 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACLYP53396 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACLYP53396 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACLYP53396 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACLYP53396 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACLYP53396 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACLYP53396 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACLYP53396 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACLYP53396 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACLYP53396 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACLYP53396 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACLYP53396 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACLYP53396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACLYP53396 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACLYP53396 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACLYP53396 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACLYP53396 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACLYP53396 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACLYP53396 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ACLYP53396 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACLYP53396 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACLYP53396 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACLYP53396 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACLYP53396 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACLYP53396 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACLYP53396 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACLYP53396 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACLYP53396 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACLYP53396 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACLYP53396 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACLYP53396 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACLYP53396 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACLYP53396 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACLYP53396 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACLYP53396 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms