Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgd1P52734 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fgd1P52734 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fgd1P52734 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fgd1P52734 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms