Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2A2P52657 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF2A2P52657 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GTF2A2P52657 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF2A2P52657 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms