Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff3P51827 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff3P51827 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff3P51827 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff3P51827 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aff3P51827 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aff3P51827 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff3P51827 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff3P51827 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aff3P51827 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff3P51827 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff3P51827 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aff3P51827 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms