Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccr1P51675 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccr1P51675 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccr1P51675 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccr1P51675 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms