Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl9P51410 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9P51410 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpl9P51410 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9P51410 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms