Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdhaP50136 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BckdhaP50136 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BckdhaP50136 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms