Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
NUP153P49790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NUP153P49790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NUP153P49790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NUP153P49790 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NUP153P49790 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NUP153P49790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NUP153P49790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NUP153P49790 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NUP153P49790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NUP153P49790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NUP153P49790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NUP153P49790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NUP153P49790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NUP153P49790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NUP153P49790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NUP153P49790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NUP153P49790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
NUP153P49790 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NUP153P49790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NUP153P49790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NUP153P49790 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NUP153P49790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NUP153P49790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NUP153P49790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NUP153P49790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NUP153P49790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NUP153P49790 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NUP153P49790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NUP153P49790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NUP153P49790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NUP153P49790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NUP153P49790 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NUP153P49790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NUP153P49790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NUP153P49790 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NUP153P49790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NUP153P49790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NUP153P49790 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NUP153P49790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
NUP153P49790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
NUP153P49790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NUP153P49790 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
NUP153P49790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NUP153P49790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NUP153P49790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP153P49790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP153P49790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP153P49790 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP153P49790 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NUP153P49790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NUP153P49790 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NUP153P49790 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP153P49790 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP153P49790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP153P49790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NUP153P49790 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.79
NUP153P49790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
NUP153P49790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP153P49790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP153P49790 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP153P49790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP153P49790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP153P49790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP153P49790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP153P49790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP153P49790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP153P49790 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP153P49790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP153P49790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP153P49790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP153P49790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP153P49790 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP153P49790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NUP153P49790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NUP153P49790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP153P49790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NUP153P49790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NUP153P49790 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP153P49790 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP153P49790 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP153P49790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NUP153P49790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP153P49790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP153P49790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP153P49790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NUP153P49790 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms