Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSNK1EP49674 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1EP49674 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSNK1EP49674 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1EP49674 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms