Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpcP49452 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpcP49452 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpcP49452 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpcP49452 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpcP49452 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpcP49452 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpcP49452 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpcP49452 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpcP49452 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpcP49452 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms