Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCN1P48444 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCN1P48444 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCN1P48444 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms