Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA4P48169 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRA4P48169 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms