Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax9P47242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax9P47242 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax9P47242 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax9P47242 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax9P47242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax9P47242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax9P47242 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms