Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nedd4P46935 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd4P46935 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nedd4P46935 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nedd4P46935 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nedd4P46935 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nedd4P46935 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nedd4P46935 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nedd4P46935 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nedd4P46935 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nedd4P46935 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nedd4P46935 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nedd4P46935 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nedd4P46935 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nedd4P46935 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nedd4P46935 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nedd4P46935 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nedd4P46935 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nedd4P46935 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms