Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brcc3P46737 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brcc3P46737 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brcc3P46737 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brcc3P46737 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms